Wykorzystanie profilowania transkrypcyjnego do opracowania testu diagnostycznego tolerancji operacyjnej u biorców przeszczepów wątroby ad 6

Doprowadziło to do identyfikacji 3 kompozytowych modeli pochodzących z qPCR zawierających 2. 7 genów wykazujących niezwykłą dokładność przy rozróżnianiu TOL z próbek innych niż TOL zarówno w treningowych, jak i niezależnych zestawach do walidacji. Eksperymenty qPCR obejmowały dodatkową grupę próbek pobranych od zdrowych, nieprzyjmowanych osobników (CONT). Pozwoliło to na porównanie wzorców ekspresji TOL i CONT. Podczas gdy sygnatury ekspresji związane z tolerancją przypominały bardziej CONT niż wzory inne niż TOL, połowa genów wyrażona w różny sposób między próbami TOL i nie-TOL była również znacząco różna przy porównywaniu próbek TOL i CONT. Wskazuje to, że znaczna część zidentyfikowanych klasyfikatorów genetycznych najprawdopodobniej jest specyficzna dla tolerancji. Potencjalny wpływ na wzorce ekspresji genów związane z tolerancją zmiennych klinicznych, takich jak wiek, czas przeszczepienia, rodzaj terapii immunosupresyjnej i status HCV, został szczegółowo omówiony w zestawie danych mikromacierzy. Zakażenie HCV miało uderzający wpływ na wzory ekspresji genowej krwi obwodowej, znacznie przewyższając wpływ samej tolerancji pod względem liczby wpływających genów. Wpływ infekcji HCV na zestaw genów najsilniej związanych z tolerancją był jednak słaby, co wyjaśnia, dlaczego 26-sondowa sygnatura mikromacierzy może prawidłowo identyfikować tolerancyjnych odbiorców niezależnie od statusu zakażenia HCV. Stwierdzono, że czas od transplantacji jest nieznacznie związany z podpisem 26-sondy pochodzącym z PAM. Jest to zgodne z obserwacją kliniczną, że biorcy wątroby z dłuższym okresem obserwacji po przeszczepie są bardziej podatni na operacyjną tolerancję (1), ale wyraźnie nie wyjaśniają różnic w ekspresji między biorącymi TOL i nie-TOL, których wykryto w naszej populacji badanej. Znaczący wpływ immunosupresji farmakologicznej na wzorce ekspresji genów związane z tolerancją został wykluczony przez negatywny wynik globalnej analizy asocjacji, a nasze odkrycie, że odbiorcy STA przewidywali, że są tolerancyjni, zostało zgrupowanych z odbiorcami TOL, co sugeruje, że wspólny podpis wyrażenia panuje niezależnie od stosowania leków immunosupresyjnych. W związku z tym dostarczamy tutaj serię niezawodnych modeli predykcyjnych zawierających uderzająco małą liczbę cech zdolnych do dokładnego rozróżnienia pomiędzy operacyjnie tolerancyjnymi biorcami wątroby a tymi, które wymagają ciągłej farmakologicznej immunosupresji na podstawie wzorów ekspresji genów krwi obwodowej. Podstawowa biologia tolerancji operacyjnej u ludzi jest nadal w dużej mierze nieznana. W obecnej pracy przeprowadziliśmy analizę całego zestawu genomów, aby uzyskać obiektywny wgląd w mechanizmy tolerancji operacyjnej po transplantacji wątroby (patrz dane uzupełniające). Ta analiza ujawniła, że sygnatura ekspresji związana z operacyjną tolerancją aloprzeszczepu wątroby charakteryzuje się głównie wzbogaceniem genów kodujących różne receptory powierzchniowe komórek NK wyrażane przez komórki T NK, CD8 + i TCR +. Wpływ komórek NK i TCR + na wzorce ekspresji związane z tolerancją został dodatkowo potwierdzony przez wykazanie istotnego związku między poziomami ekspresji najbardziej informatywnych genów i częstotliwości komórek NK T krwi obwodowego a. TCR + i przez stwierdzenie, że w biorcach TOL zarówno komórki TCR +, jak i NK (wraz z innymi podzbiorami PBMC) wykazują unikalne markery ekspresyjne. Istnieją 2 główne podzestawy komórek TCR + T w ludzkiej krwi obwodowej: V (1 i V (2. U zdrowych osobników komórki T V. 2TCR + przeważają przeważnie we krwi obwodowej (> 80%), podczas gdy komórki T V. 1TCR + są głównym podtypem w tkankach, takich jak jelita, wątroba i śledziona (13). U operacyjnie tolerancyjnych biorców wątroby, przeciwnie, komórki T V. 1TCR + krwi obwodowej ekspandują i zazwyczaj przewyższają liczbę komórek T V. 2TCR + (10, 11). Nasza obecna analiza wskazuje, że komórki T V. 1TCR + są jedynym podzestawem komórek TCRTT wyraźnie wpływającym na sygnatury transkrypcyjne związane z tolerancją. Ponadto dostarczamy dowodów na to, że komórki T V. 1TCR + krwi obwodowej od tolerancyjnych biorców wątroby wykazują wyjątkową ekspresję i cechy powierzchni komórki, które odróżniają je od tych obecnych u nietolerancyjnych biorców lub zdrowych osobników nieprzeszkadzających. Wiadomo, że komórki T V. 1TCR + wywierają funkcje immunoregulacyjne w różnych warunkach eksperymentalnych i klinicznych nieprzeszczepienia (14. 19). W transplantacji wątroby potrzebne są dalsze badania, aby przeanalizować właściwości funkcjonalne komórek T V. 1TCR + i określić, czy te komórki mają bezpośrednie zdolności tłumiące w alloagresywnych limfocytach lub działać poprzez wytwarzanie czynników wzrostu i naprawianie uszkodzeń tkanek, jak wykazano w jelitach. śluzówka (18, 20-22). Na podstawie przedstawionej tu ekspresji genów i cytometrii przepływowej jasne jest, że tolerancyjni biorcy wątroby różnią się nie tylko od biorców wymagających immunosupresji podtrzymującej.
[hasła pokrewne: odkwaszanie organizmu cytryna, uzależnienie od leków przeciwbólowych, zaburzenia psychiczne u dzieci ]
[więcej w: piramida żywieniowa dla dzieci, uzależnienie od leków przeciwbólowych, choroba refluksowa dieta ]